Hola...

He tenido algunos problemas con la reproduccion de algunos videos en formato .MOV y buscando por aqui y por alla y logre esta pequeña linea para convertirlos a .AVI que es un formato usable en linux...

 Me he ayudado de programa ffmpeg

fvasquez@linux:~/Escritorio$ sudo apt-get install ffmpeg 

y ahora solo tenemos que correr la siguiente linea obviamente cambiando los nombres de los archivos...

fvasquez@linux:~/Escritorio$ ffmpeg -i entrada.mov -g 60 -vcodec msmpeg4v2 -acodec pcm_u8 salida.avi

 Espero que les sirva...

Faustino Vasquez Limon

Linux User